{"id":18247,"date":"2023-07-11T14:46:06","date_gmt":"2023-07-11T17:46:06","guid":{"rendered":"http:\/\/grupomontevideo.org\/site\/?p=18247"},"modified":"2023-07-11T15:35:30","modified_gmt":"2023-07-11T18:35:30","slug":"tecnicas-de-biofisica-celular-y-molecular","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/grupomontevideo.org\/site\/tecnicas-de-biofisica-celular-y-molecular\/","title":{"rendered":"T\u00e9cnicas de Biof\u00edsica Celular y Molecular"},"content":{"rendered":"\n

Instituciones involucradas <\/strong><\/p>\n\n\n\n

Universidad Nacional del Litoral (Argentina), Universidade Estadual de Campinas (Brasil), Universidad de Chile (Chile) <\/p>\n\n\n\n

<\/p>\n\n\n\n

Destinatarios <\/strong><\/p>\n\n\n\n

Los destinatarios de este curso son alumnos de posgrado de carreras relacionadas con Ciencias Biol\u00f3gicas, F\u00edsica y Biof\u00edsica. De acuerdo con la disponibilidad de vacantes podr\u00e1n admitirse alumnos de grado que est\u00e9n cursando el \u00faltimo a\u00f1o de bioqu\u00edmica, biolog\u00eda, qu\u00edmica, biotecnolog\u00eda, f\u00edsica y otras afines. <\/p>\n\n\n\n

<\/p>\n\n\n\n

Duraci\u00f3n del curso, indicando cr\u00e9dito horario total<\/strong><\/p>\n\n\n\n

La modalidad virtual del curso tendr\u00e1 45 hs totales de duraci\u00f3n de las cuales 30 h ser\u00e1n de clases sincr\u00f3nicas y 15 h de actividades no presenciales y tutor\u00edas online. El curso contar\u00e1 adem\u00e1s con 5 trabajos pr\u00e1cticos presenciales en la Universidade Estadual de Campinas con un total de 21 h de cursado. <\/p>\n\n\n\n

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Contenidos a desarrollar<\/strong><\/p>\n\n\n\n

TEMAS <\/p>\n\n\n\n

1- Fluorescencia, sondas y microscopia <\/p>\n\n\n\n

Introducci\u00f3n al fen\u00f3meno de fluorescencia. Propiedades generales de sondas fluorescentes. Fluor\u00f3foros org\u00e1nicos, inorg\u00e1nicos y prote\u00ednas fluorescentes. Sondas sensibles al entorno y fotoconversiones. T\u00e9cnicas de microscop\u00eda \u00f3ptica de fluorescencia. FRAP, FRET y FLIM. Estrategias de an\u00e1lisis. <\/p>\n\n\n\n

2- Pinzas \u00f3pticas <\/p>\n\n\n\n

Parte 1: Teor\u00eda: Historia de la manipulaci\u00f3n \u00f3ptica, fundamentos, setup del equipamiento, calibraci\u00f3n. Parte 2: Aplicaciones: Biof\u00edsica de mol\u00e9culas \u00fanicas, Biof\u00edsica de membranas, Sistemas coloidales. 3- Biolog\u00eda Computacional <\/p>\n\n\n\n

– Introducci\u00f3n a las simulaciones: coordenadas, funci\u00f3n de energ\u00eda y nivel de granulado, m\u00e9todos de muestreo: din\u00e1mica molecular y Monte Carlo <\/p>\n\n\n\n

– Implementaci\u00f3n de MD: algoritmos de integraci\u00f3n, PBC, truncamiento y algoritmos de correcci\u00f3n de largo alcance para interacciones no ligadas, acoplamiento de temperatura y presi\u00f3n – Muestreo estad\u00edstico: variables colectivas, Umbrella Sampling, metadin\u00e1mica, muestreo mejorado de m\u00faltiples variables-. M\u00e9todos multiescala: QM\/MM y embedding electrost\u00e1tico. – Modelos de grano grueso: alcances, modelos m\u00e1s comunes y ejemplos <\/p>\n\n\n\n

– Modelos de mesoescala: alcances y ejemplos <\/p>\n\n\n\n

– Combinaci\u00f3n de escalas experimentales y de simulaci\u00f3n, aplicaciones avanzadas para virus y c\u00e9lulas completos <\/p>\n\n\n\n

4- Infrarrojo <\/p>\n\n\n\n

Fundamentos, IR aplicado a sistemas biol\u00f3gicos: consideraciones pr\u00e1cticas, estudio de membrans biol\u00f3gicas por IR, estudio de prote\u00ednas por IR, ejercicios y procesamiento de datos. 5- Resonancia Magn\u00e9tica Nuclear <\/p>\n\n\n\n

Parte I: Conceptos b\u00e1sicos, experimentos b\u00e1sicos, (1D, 2D, TOCSY, NOESY, 1H\/15N-HSQC), Din\u00e1mica de prote\u00ednas (escala de tiempo y tipo de experimentos). <\/p>\n\n\n\n

Parte II: Aplicaciones en biolog\u00eda estructural (Determinaci\u00f3n de estructura, uni\u00f3n del ligando, cin\u00e9tica, an\u00e1lisis conformacional, etc.), Metabol\u00f3mica, Otras aplicaciones. <\/p>\n\n\n\n

6- Cristalograf\u00eda de Rayos X <\/p>\n\n\n\n

– Cristalizaci\u00f3n de prote\u00ednas, Celda unitaria y simetr\u00eda cristalogr\u00e1fica (concepto de grupos espaciales) – Difracci\u00f3n I: rayos X y su interacci\u00f3n con la materia. Conceptos b\u00e1sicos de onda y Rayos X. Difracci\u00f3n de cristales (ley de Bragg) y planos de Miller. Relaci\u00f3n espacio directo y rec\u00edproco: concepto de transformada de Fourier. <\/p>\n\n\n\n

– Difracci\u00f3n II: el experimento de difracci\u00f3n con un cristal, y como reconstruir la densidad electr\u00f3nica. El experimento de difracci\u00f3n: informaci\u00f3n obtenida ( amplitudes de ondas e \u00edndices de miller) El problema de las fases y metodolog\u00edas para resolver. <\/p>\n\n\n\n

Densidad electr\u00f3nica y refinamiento de la estructura <\/p>\n\n\n\n

– Validaci\u00f3n: Calidad de los datos medidos y del modelo 3D (Victor) <\/p>\n\n\n\n

Calidad de la informaci\u00f3n experimental (consistencia interna, valores R y CC, etc) Validaci\u00f3n del modelo, factores R, consistencia estereoqu\u00edmica y correlaci\u00f3n densidad electr\u00f3nica modelo (RSRZ) <\/p>\n\n\n\n

Herramientas del PDB para validaci\u00f3n(wwPDB Validation) <\/p>\n\n\n\n

7- Dicro\u00edsmo Circular <\/p>\n\n\n\n

Parte 1: Teor\u00eda: Aspectos generals de espectroscop\u00eda de absorci\u00f3n, fundamentos de espectrooscopia de Dicro\u00edsmo Circular, equipamiento, Ventajas de la Radiaci\u00f3n sincrotr\u00f3n de Dicro\u00edsmo Circular. (l\u00ednea CEDRO \/Sirius) <\/p>\n\n\n\n

Parte 2: Aplicaciones: Determinaci\u00f3n de la estructura secundaria de prote\u00ednas, Prote\u00ednas globulares vs. prote\u00ednas de membrana, Films de prote\u00ednas deshidratadas, Prote\u00ednas intr\u00ednsecamente desordenadas, CD orientado, Otras biomol\u00e9culas\/biomaterials. <\/p>\n\n\n\n

8- Microscop\u00eda de fuerza at\u00f3mica y espectroscop\u00eda de fuerza (AFM-FS) <\/p>\n\n\n\n

Parte I: Microscop\u00eda de Fuerza At\u00f3mica: principio y aplicaciones: Componentes b\u00e1sicos de un AFM, C\u00f3mo funciona y modos de operaci\u00f3n, Sensores de fuerza, Instrumentaci\u00f3n, Preparaci\u00f3n de muestras, Ventajas y limitaciones de AFM <\/p>\n\n\n\n

Parte II: Espectroscop\u00eda de Fuerza: principio y aplicaciones: Curvas fuerza-distancia, Propiedades mec\u00e1nicas, Reconocimiento molecular, Nuevas t\u00e9cnicas.<\/p>\n\n\n\n

<\/p>\n\n\n\n

Perspectiva pedag\u00f3gica y metodolog\u00eda <\/strong><\/p>\n\n\n\n

La modalidad virtual del curso tendr\u00e1 45 hs totales de duraci\u00f3n de las cuales 30 h ser\u00e1n de clases sincr\u00f3nicas y 15 h de actividades no presenciales y tutor\u00edas online. <\/p>\n\n\n\n

El curso tendr\u00e1 66 hs totales de duraci\u00f3n. La modalidad virtual y constar\u00e1 de 30 h de clases sincr\u00f3nicas y 15 h de actividades asincr\u00f3nicas y tutor\u00edas online. Las clases ser\u00e1n dictadas en espa\u00f1ol y portugu\u00e9s. Los encuentros ser\u00e1n semanales y durar\u00e1n aproximadamente 3 horas diarias (1.5 h de teor\u00eda y 1.5 h de aplicaciones). En esta \u00faltima se presentan los fundamentos y detalles t\u00e9cnicos de cada unidad tem\u00e1tica y se plantean las actividades que deben desarrollarse individualmente o en grupos antes de la clase pr\u00e1ctica de la semana siguiente, donde se discutir\u00e1n y complementar\u00e1 el desarrollo de la unidad antes de comenzar con la unidad siguiente. Se fijar\u00e1 un medio de comunicaci\u00f3n no sincr\u00f3nico para habilitar la tutor\u00eda de los alumnos durante las actividades asincr\u00f3nicas. <\/p>\n\n\n\n

Del total de los alumnos 20 ser\u00e1n seleccionados de acuerdo a su rendimiento acad\u00e9mico para la realizaci\u00f3n de trabajos pr\u00e1cticos presenciales en la Universidade Estadual de Campinas. Los trabajos pr\u00e1cticos ser\u00e1n basados en 5 t\u00e9cnicas: Dicro\u00edsmo circular, AFM, cristalograf\u00eda de Rayos X, NMR e IR. <\/p>\n\n\n\n

M\u00e9todo de evaluaci\u00f3n<\/strong>
La evaluaci\u00f3n ser\u00e1 en forma de presentaci\u00f3n de un trabajo al final del curso. El mismo incluir\u00e1 alguna de las t\u00e9cnicas presentadas durante el mismo que sea utilizada para estudiar un sistema relacionado con membranas. <\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

Instituciones involucradas  Universidad Nacional del Litoral (Argentina), Universidade Estadual de Campinas (Brasil), Universidad de Chile (Chile)  Destinatarios  Los destinatarios de este curso son alumnos de posgrado de carreras relacionadas con Ciencias Biol\u00f3gicas, F\u00edsica y Biof\u00edsica. De acuerdo con la disponibilidad de vacantes podr\u00e1n admitirse alumnos de grado que est\u00e9n cursando el \u00faltimo a\u00f1o de bioqu\u00edmica, […]<\/p>\n","protected":false},"author":3,"featured_media":0,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[48],"tags":[],"class_list":["post-18247","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-archivo-de-noticias"],"wpmagazine_modules_lite_featured_media_urls":{"thumbnail":"","cvmm-medium":"","cvmm-medium-plus":"","cvmm-portrait":"","cvmm-medium-square":"","cvmm-large":"","cvmm-small":"","full":""},"categories_names":{"48":{"name":"Archivo de noticias","link":"https:\/\/grupomontevideo.org\/site\/category\/archivo-de-noticias\/"}},"tags_names":[],"comments_number":"0","_links":{"self":[{"href":"https:\/\/grupomontevideo.org\/site\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/18247","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/grupomontevideo.org\/site\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/grupomontevideo.org\/site\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/grupomontevideo.org\/site\/wp-json\/wp\/v2\/users\/3"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/grupomontevideo.org\/site\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=18247"}],"version-history":[{"count":2,"href":"https:\/\/grupomontevideo.org\/site\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/18247\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":18257,"href":"https:\/\/grupomontevideo.org\/site\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/18247\/revisions\/18257"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/grupomontevideo.org\/site\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=18247"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/grupomontevideo.org\/site\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=18247"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/grupomontevideo.org\/site\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=18247"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}